日签 销签 行程不一致怎么办？

本人特别倒霉，护照在领馆扣了很多天，然后代办的旅行社说被抽查查到了...
于是按要求上交了份详细的行程单，但是实际行程和行程单上有略微的不符，但是入境日本和离境日本的航班信息都是一样，只是具体入住不一样。
求问会有什么影响，或者现在该怎么办？

谢谢！