东本愿寺（ひがしほんがんじ）是净土真宗教派真宗大谷派的本山，位于日本京都府京都市下京区，建于1602年，正式名称为真宗本庙。净土真宗本愿寺派第11代法主显如于1592年去世后发生对立纷争。1602年显如长子教如得到大名德川家康支持创立教团，脱离显如三子，第12代门主准如主持的原本愿寺教团，另建新教团，但教如仍坚持自己是本愿寺正宗继承者，本愿寺第12代法主。由于新建寺院位于本愿寺派本山东侧，当地人习惯称之为“东寺”（お东），久之通称为东本愿寺。
东本愿寺在江户时期曾四次遭火灾焚毁，现在寺院主体建筑为明治时期重建。日本时代大谷派曾来台湾布教，并曾在台北万华建立东本愿寺。
